^^IsoDDE  Isomorphic Labs Drug Design Engine

 

2026-02-10 https://www.isomorphiclabs.com/articles/the-isomorphic-labs-drug-design-engine-unlocks-a-new-frontier

 

Isomorphiclabs e' uno spin-of di Deep Mind, Demis Hassabis co-founder & Ceo.

IsoDDE  Isomorphic Labs Drug Design Engine

in un certo senso e' la prosecuzione-estensione di AlphaFold che ha rivoluzionato la previsione delle strutture proteiche ("vincendo il Nobel 2024 per la chimica").

IsoDDE si concentra sull'ingegneria e sulla progettazione di farmaci (drug design), superando i limiti di generalizzazione di AlphaFold 3 su nuovi target terapeutici

  1. Raddoppia la precisione di AlphaFold 3

    su sistemi proteina-ligando "out-of-distribution" (cioe' altamente dissimili da quelli usati durante l'addestramento), gestendo meglio i cambiamenti di forma della proteina (induced fits) e l'apertura di tasche "criptiche".

  2. Miglioramento su anticorpi

    Nel contesto del design di farmaci biologici, IsoDDE ha superato AlphaFold 3 di 2,3 volte nel predire interfacce anticorpo-antigene ad alta fedeltą (DockQ > 0.8).

  3. Modellazione del loop CDR-H3

    IsoDDE ha migliorato la capacitą di modellare il loop CDR-H3, la parte pił variabile e difficile da prevedere in un anticorpo, fornendo un salto di precisione rispetto ai modelli precedenti.

  4. Affinitą di legame

    IsoDDE supera i metodi basati sulla fisica per predire l'affinitą di legame (la forza con cui un farmaco si lega a un bersaglio), offrendo precisione di livello sperimentale in secondi.