^^AlphaFold. Proteins folding.

Rivoluzione bioinformatica. Dal genoma al proteoma. Rivoluzionato il calcolo della struttura 3D di una proteina.

30-11-2020 AlphaFold vince la competizione CASP14 Critical Assessment of protein Structure Prediction

youtube video promozionale accattivante e breve (8'), da vedere, che rende l'idea.

Sappiamo che questo e' il secolo della biologia

ma ho anche l'idea che

quindi dopo la rivoluzione informatica che si sta compiendo, si e' aperta-sovrapposta la rivoluzione biologica, in totale

la rivoluzione e' bio-informatica

 

Le scienze, Settembre 2021

Rivoluzione bioinformatica. Dal genoma al proteoma. Rivoluzionato il calcolo della struttura 3D di una proteina.

  1. wp/AlphaFold [articolo su wikipedia in inglese, in it 2021 non c'e']  dice tutto quel che c'e' da sapere.
  2. 30-11-2020 AlphaFold vince la competizione CASP14 Critical Assessment of protein Structure Prediction
    1. youtube video promozionale accattivante e breve (8'), da vedere, che rende l'idea; mostra la metrica di prossimita' al risultato esatto: GDT_Global_Distance_Test.
    2. “This really is a big deal,” says David Baker, head of the Institute for Protein Design at the University of Washington and leader of the team behind Rosetta, a family of protein analysis tools. “It’s an amazing achievement, like what they did with Go.” [con AlphaGo nel 2016, 4 anni prima] cit: technologyreview
  3. 5-3-2021 youtube DeepMind’s Demis Hassabis on its breakthrough scientific discoveries | WIRED Live
  4. 15-7-2021 [articolo originale nature] Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold.

    The ‘protein folding problem’ has been an important open research problem for more than 50 years.

    1. L'intelligenza artificiale AlphaFold ha calcolato la struttura 3D di quasi ogni proteina del corpo umano
      • la prossimita' al risultato esatto e'
        maggiore del 90% per piu' di 1/3 dei casi !!!
    2. I risultati sono stati registrati nel AlphaFold Protein Structure Database, di libero accesso !!!
    3. il codice dell'IA e stato reso open source !!!
  5. 22-7-2021 [articolo divulgativo techcrunch] DeepMind puts the entire human proteome online, as folded by AlphaFold.
  6. 27-7-2021 [video divulgativo youtube] AlphaFold and the Grand Challenge to solve protein folding.
    1. Dogma_di_Anfinsen la struttura ripiegata di una proteina e' determinata solamente dalla sequenza dei suoi amminoacidi
    2. Paradosso_di_Levinthal il ripiegamento della proteina non e' calcolabile considerando tutti i suoi possibili ripiegamenti, poiche' sono un numero troppo grande.

 

Links

  1. wp/AlphaFold [articolo su wikipedia in inglese, in it 2021 non c'e', nel giugno2023 c'e']  dice tutto quel che c'e' da sapere.
  2. AlphaGo.
  3. Artificial intelligence timeline.